Supernova: Протоколът “Charon” е вертикална стрелба с битки срещу флагмани
Корабът се стреля сам, така че почти винаги избягвате вражеските куршуми. Маршрутът преминава от орбитата на Земята до разлом в празнотата и минава през 11 сектора. Всеки сектор има свое собствено небе, свои собствени препятствия и собствени вълни от врагове. Ако след Star Wing искате шутър с кампания и хангар между полетите, тук можете да намерите и двете.
Флагманът в края на сектора
Всеки сектор завършва с битка с флагмана, като тази битка има няколко фази. Флагманските кули могат да бъдат свалени една по една и с всяка свалена кула огънят намалява. Играта ще прости една грешка в тази битка, но не и втората.
Девет варела и хангар
В играта има девет вида оръжия: Pulse, Spread, Laser, Missiles, Plasma, Arc, Wave, Boomerang и Railgun. Всеки от тях се подсилва директно в битка. За битки получавате кредити, а между полетите ги харчите в хангара. Има 6 корпуса, дронове, бомбен отсек, ескорт полет и 6 кожи. За умение в битка играта дава медали и ордени, общо 20.
Плътният огън на враговете е познат от Neon Space Shooter, но тук има два инструмента срещу него. Фокусът намалява скоростта наполовина и показва зоната, в която попадат куршумите. Бомбата изчиства екрана от вражески снаряди. Кампанията може да бъде завършена на едно от трите нива на трудност или с двама играчи на една и съща клавиатура.